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Benchling veut automatiser les laboratoires sans imposer un fournisseur unique

Benchling Automation relie instruments, cellules de travail et dossiers scientifiques au sein d’un même workflow. La solution fonctionne avec des équipements de différents fabricants et peut s’intégrer à Benchling comme à d’autres plateformes ELN/LIMS.

L’automatisation des laboratoires se heurte encore à une difficulté récurrente : chaque nouvel instrument peut nécessiter une intégration spécifique, du code adapté à son format de données et parfois une reconstruction du workflow lorsqu’un équipement change. Benchling veut réduire cette dépendance avec Benchling Automation. Sa nouvelle solution orchestre les expériences entre les instruments de laboratoire, les systèmes d’automatisation et les dossiers scientifiques, sans imposer l’utilisation du matériel ou de l’environnement logiciel d’un fournisseur unique.

La plateforme a été développée avec plusieurs acteurs de l’automatisation scientifique, notamment HighRes, Automata, Ginkgo Bioworks, Celltrio, Opentrons et Hamilton.

Conserver le choix du matériel

Des intégrations standardisées permettent aux workflows conçus dans Benchling d’être exécutés directement sur les équipements des partenaires. Les équipes peuvent ainsi faire évoluer leur infrastructure sans reconstruire leurs processus à chaque changement de matériel. Benchling Automation peut également fonctionner avec une plateforme ELN/LIMS différente de celle de Benchling.

« Les laboratoires en boucle fermée sont faciles à présenter, mais difficiles à exploiter en production. Les systèmes supposent souvent l’usage du matériel ou de l’environnement de données d’un seul fournisseur, alors que les laboratoires utilisent des équipements et logiciels de nombreux fabricants », explique Derek Halliday, Head of Product chez Benchling.

Plus de 200 instruments connectables

Les équipes peuvent récupérer dans Benchling les données provenant de plus de 200 instruments par fichiers ou API, notamment des lecteurs de microplaques, manipulateurs de liquides, analyseurs de culture cellulaire et systèmes de PCR quantitative. Les workflows déclenchés après une analyse peuvent ensuite être créés ou modifiés sans développement spécifique. Une logique conçue une première fois peut être réutilisée à chaque exécution puis mise à jour sans reconstruire l’ensemble du processus.

Avec Automation, Benchling cherche ainsi à faire de l’interopérabilité une condition de l’automatisation scientifique, plutôt que d’obliger les laboratoires à standardiser leurs équipements autour d’un seul écosystème.